Хабаров встретил будущую жену еще в студенческие годы. Елена покорила сердце юного красавца, однако на тот момент у нее был молодой человек. Но Антон не сдался, он был уверен, что Елена его судьба.
Тогда ему пришлось стать лучшим другом девушки и давать ей неправильные советы, относительные к любовным делам. Антон признался, что ни капли не жалеет об этом, ведь любовь оказалась настоящей.
Вскоре они сблизились и начали встречаться. В 2007 году пара сыграла свадьбу. За неделю до торжества Хабарову пришлось на время покинуть город из-за съемок. Родные невесты были уверены, что молодой актер уже не вернется, но Антон вернулся за день до свадьбы.
В том же году у пары родился первенец, а через 3 года на свет появилась дочь.
Антон и Елена очень строги в плане воспитания, благодаря чему у них растут умные дети. Сын Влад интересуется спортом и программированием.